大通桥站为2号线与3号线的换乘站，车站位于规划中的青云路和锦堂路的丁字形路口，东侧紧邻大通河，主体呈东西向布置。 2号线车站为地下二层岛式车站，3号线车站为地下三层岛式车站。地下一层为站厅层(换乘大厅)，地下二层为2号线站台层及3号线设备层，地下三层为3号线站台层。车站设自动售检票机12台，闸机27台，客服中心2个。运营初期开放A、D、E、F四个出入口。A出入口位于规划锦党路东侧(大通河边)，青云路和锦堂路的交叉路口;D出入口位于规划青云路与规划锦党路交叉路口(青云路北侧);E出入口位于规划青云路与规划锦党路交叉路口(青云路南侧);F出入口位于环城北路与大通北路交界处。