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自1994年新疆维吾尔自治区地方税务局成立以来，承担着新疆166万平方公里的征收管理工作，主要征收营业税、企业所得税、个人所得税等13个税种。全区地税系统下设19个地州市地税局(不包括直征局和稽查局)，86个县(市、区)地税局，其他直属派出机构22个，294个基层税务所。

具体职责包括：

(一)贯彻执行国家税收工作的方针、政策和各项税收法律、法规和规章，研究制订地方各税、费征收管理实施办法、细则和规定。

(二)检查监督各部门、各单位和全省各级地方税务机关贯彻执行税收法律、法规和规章的情况。

(三)负责全省地方税务局征收的税种和地方国有企业所得税及基金的征收管理工作，负责集体企业所得税汇算清缴和集体企业、私营企业的财务管理工作。

(四)负责汇总编报全省地税系统税收计划以及税收会计、统计报表工作。

(五)组织实施税收征收管理体制改革，制定征收和票证管理制度并检查监督制度的落实。

(六)管理地方税务系统的人事、劳动工资、机构编制和经费;按干部管理权限负责系统内干部的考核、任免工作。

(七)负责地方税务系统干部队伍的思想政治工作和精神文明建设以及教育培训工作。

(八)组织税收理论研究和税收政策、法规宣传。

(九)办理省委、省政府和国家税务总局交办的其他事项。